En la cuenta vivienda te podrás desgravar por la MITAD de las cantidades que entregues antes de la entrega de llaves, ya que realmente sólo estarás adquiriendo el 50% de la propiedad.
Si luego te vende tu tío el 50% restante, tú te deberías encargar de todos los gastos de la transmisión (impuesto de transmisiones patrimoniales del 6%, impuesto de actos jurídicos documentados -creo que del 0,5%-, gastos de notaría y registro). Todos estos porcentajes aplicarían sobre la mitad del valor de la vivienda, que es lo que te "vendería" tu tío.
Y un consejo: Por mucho que quieras a tu tío, contrato privado de por medio. Creéme, es más seguro.