Una pequeña puntualización, yo tengo dos hojas que pone que es el modelo 601, en la que apaqrece en número de protocolo es una que, en mi caso, lleva una pegatina arriba a la derecha de la Dirección General de Tributos.
Por otro lado, también he encontrado un cuarto y quinto sitio en el que aparece el número de protocolo. Si recuerdas, pasado un tiempo de haber firmado las escrituras debiste recibir una carta indicando que ya podías ir a recogerlas y que además existía un saldo a tu favor del recibo que se entregó a cuenta para los gastos notariales.
En esta carta también aparece el número de protocolo en la esquina superior izquierda.
Y por último, junto con las escrituras también deberías tener un papel con el escudo del ayuntamiento de Madrid con el título de "Impuesto sobre el incremento del valor de los terrenos de naturaleza urbana"
En el primer apartado (Documento) aparece una casilla con el número de protocolo.
Pues creo que eso es todo, ahora sólo falta que no hayas perdido ninguno de los papeles ;-p