Según mis informaciones no debería haber problema con el levantamiento de acta, la cuestión es que si tu no estas de acuerdo con algo que viene reflejado en escritura puedes y debes hacerlo constar al notario para que sea este el que de fe de tu no conformidad, ahora bien como se dijo en algún momento de la reunión debes aclarar con detalle en que no estas de acuerdo y exponerlo claramente para que quede recogido en el acta, debes de tener una base solida para exponer tú no conformidad con el/los puntos en cuestión.