si en tu hipoteca no se marca comisión de cancelación total, no deberían cobrarte comisión de cancelación total. la ley marca un tope máximo, no obliga a que haya que pagar eso.
si además, como dices, tienes comisión por amortización parcial, es que las condiciones eran esas: pagas si amortizas parcialmente pero no si lo amortizas todo.
en cualquier caso, nunca está de más llevarlo al otro banco y que revisen bien el contrato, no vaya a ser...
un saludo