Ningún banco ni caja te va a permitir hacer una cancelación parcial 1º de 109.999 y luego la total por el resto, si el que te está concediendo el préstamo es otro banco, te lo puedo asegurar. Otra cosa es que tú, por el motivo que sea, tengas todo ese dinero ahorrado o lo que sea, entonces sí se puede hacer la cancelación parcial por casi todo y luego la parcial por algo simbólico.
RaulyLau tienes razón: todas las hipotecas, a partir creo de abril de 2003, que se firmen, tienen una comisión de cancelación por subrogación del 0,5%, aunque en escrituras diga otra cosa, según la ley.